١- تخضع التنظيمات على المستوى المحلي والوطني من أجل اختيار المشاركين في الأولمبياد GPhO لرؤية كل دولة من الدول الأعضاء بالمكتب.
٢- التنظيمات على المستوى الإقليمي وتكون على النحو الآتي:
(برئاسة مكتب التربية العربي لدول الخليج، وعضوية مندوبي وزارة التربية والتعليم، ورؤساء اللجان العاملة على المستوى الإقليمي)، ومن المهام الرئيسة لها اعتماد الخطط الإستراتيجية والخطط التشغيلية للأولمبياد.
تتشكل من رؤساء الوفود المشاركة ونوابهم، ورئيس اللجنة العلمية من الدولة المضيفة وممثلي مكتب التربية العربي لدول الخليج إضافة إلى واضعي الأسئلة ( الفريق العالمي ) وتتلخص مهام لجنة التحكيم والإشراف على المسابقة فيما يأتي:
١- مراجعة ترجمة أسئلة الاختبار النظري والعملي _ في يومين مختلفين _ التي أعدها الفريق العالمي ومواءمتها في نفس يوم الاختبار قبل عقده بساعتين على الأكثر مع بقاء اللجنة في موقعها حتى الإنتهاء من الرد على أسئلة الطلبة المكتوبة.
٢- البت في حال وجود أي خلاف ينشأ من رئيس وفد أي دولة من الدول الأعضاء، مع لجنة واضعي الاختبار وتصحيحه، حول تصحيح أي سؤال، ويعتبر قرارها نهائياً.
٣- الاطلاع على نتيجة المسابقة واعتمادها، والمحافظة على سريتها وعدم نشرها بأي وسيلة لحين إعلانها رسميًّا.
٤- الإشراف على أعمال النظام والمراقبة. في الاختبارين النظري والعملي.